生命科學領域集群存儲

方案概述

隨著高通量測序實驗及生物信息學在人類健康領域的應用,數據呈現出快速的增長,其業務場景特有的多任務分析流程力求自動化實現數據大量的迭代運算和反復讀寫,對存儲系統提出了新的挑戰。有效的存取大規模生物數據,將對匹配業務的開展和完成起到提高效率的作用。

應用背景

生命科學從細胞的發現到生物工程、基因工程的發展及應用,研究變得更加趨于系統化、規模化、數字化。突出表現之一便是一大批生物基因組測序的完成,催生了生物信息學的迅速發展。

高通量測序實驗技術以及生物信息學在生命科學研究和人類健康領域的應用,將生物信息轉化為數字信息,這些數據來自于大量的生物樣本、科研中間數據和實驗結果,數據類型以文件為主,通過多次的、多工作組的科學計算。這些數字信息如同開采金礦一樣,等待被挖掘出價值。因此,海量生物數據的存儲、讀取、挖掘處理面臨著機遇與挑戰。

系統功能



  • 集群存儲支持多維度擴展,按需建設
  • 容量與IO 負載均衡到節點,聚合帶寬,適合高通量并發訪問需求
  • 統一虛擬存儲池,為不同計算環境或應用展現相同的空間視圖
  • Docker 化部署,應用程序及分析工具和存儲共生
  • 支持計算任務offload 到集群存儲,開放性強
  • 集群獨立高速內部通道,快速數據分發及均衡分布
  • 兼容主流HDD、OS、訪問協議,通用性好

方案特色


榮之聯Xtore 分布式集群存儲系統,幫助客戶解決數據空間和數據持久化。提供彈性的、并發的PB 級統一存儲資源池,滿足計算集群幾十個至上百個節點并發讀寫、數據共享。其可擴展特性,易于實現非結構化數據快速增長下的逐步擴容。Xtore 整合生產、科研、儀器的存儲需求,達成數據在分析流程各環節中流動,支持流程自動化的實現。

Xtore 系統,支持容器化部署,可將客戶部分計算分流到存儲系統,優化數據流向、降低網絡負荷,切實提高生產效率。

客戶價值

  • 根據業務的需求動態擴展存儲規模,降低一次性設備采購投入
  • 聚合帶寬,并發訪問,滿足幾十至上百個計算集群的同時訪問
  • 實效性,實驗數據上傳后即可進入多任務分析流程,縮短計算周期,提高時效性和生產科研效率
  • 基于以太網高速互連,支持標準訪問協議,完全與計算平臺兼容
  • 存儲系統容器化,與應用共生,合理匹配與利用計算存儲資源
  • 內置數據特征引擎,通過與數據管理對接,進一步提升復雜數據的處理能力

典型案例

北京吉因加科技有限公司(Gene+)以基因科技為核心,從事醫學健康領域的科學研究、應用開發和產業服務,是一家集科研、臨床檢測和健康服務于一體的基因科技公司。


公司專注于腫瘤基因檢測領域,按照國際臨床基因檢測實驗室標準搭建,目前已形成基于高通量基因測序技術與生物信息分析的ctDNA 精準檢測體系,實現了對腫瘤無創、準確、動態的基因分析,為臨床提供精準用藥、療效監測、術后復發監測、風險預測和早期檢測等服務。



  • 利用Xtore 分布式集群存儲系統,解決業務系統原始數據、過程數據和結果數據的存放和讀取問題
  • 融合應用容器和存儲系統,允許生物分析計算將非計算密集型任務卸載給存儲控制器
  • 存儲系統與生物計算調度的緊密融合,讓存儲系統感知應用特征,調度合適的存儲資源
  • 存儲系統同時兼顧可靠性、可用性和訪問帶寬,不間斷持續提供存儲服務

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